El 11 de diciembre de 2017 se presentó por primera vez en el entrenamiento de Boca Juniors, recién llegado de Huracán. Debutó en un partido amistoso ante Aldosivi en los torneos de verano, donde marcó su primer gol, en el empate 2-2.
Su primer gol oficial lo marcó ante Club Atlético San Martín (San Juan) el 25 de febrero de 2018, en la victoria 4-2.
Los 36 goles de Wanchope en Boca:
Fueron 36 goles en 83 partidos (48 como titular)
Además consiguió 3 títulos en el club:
Superliga 2017/18
Superliga 2019/20
Copa Diego Maradona 2020/21
